Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCHIP1Q9P0W5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms