Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA2D2Q9NY47 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA2D2Q9NY47 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms