Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ALKBH4Q9NXW9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms