Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CWC25Q9NXE8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CWC25Q9NXE8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms