Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR3EQ9NVU0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms