Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ASF1BQ9NVP2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms