Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GJB4Q9NTQ9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GJB4Q9NTQ9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms