Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC6A13Q9NSD5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms