Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPHS2Q9NP85 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPHS2Q9NP85 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms