Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAT1LQ9HCJ6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms