Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SEBOXQ9HB31 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms