Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UPF2Q9HAU5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF2Q9HAU5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms