Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBPF3Q9H094 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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