Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLR1EQ9GZS1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms