Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms