Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM55Q9BYV6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRIM55Q9BYV6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms