Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
GABARAPL3Q9BY60 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GABARAPL3Q9BY60 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms