Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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