Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYCP2Q9BX26 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms