Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS4Q9BT78 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms