Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms