Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBF4Q9BQW3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms