Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABRG3Q99928 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRG3Q99928 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms