Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PITX2Q99697 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PITX2Q99697 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms