Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms