Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIN3AQ96ST3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIN3AQ96ST3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms