Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms