Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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C9orf85Q96MD7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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C9orf85Q96MD7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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C9orf85Q96MD7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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C9orf85Q96MD7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C9orf85Q96MD7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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