Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms