Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
EP400Q96L91 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EP400Q96L91 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms