Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP47Q96K76 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP47Q96K76 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
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