Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDLIM2Q96JY6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PDLIM2Q96JY6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms