Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CENPNQ96H22 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPNQ96H22 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms