Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms