Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC35A4Q96G79 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms