Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NEIL1Q96FI4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms