Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIRT1Q96EB6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms