Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ULK4Q96C45 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ULK4Q96C45 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms