Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFHD2Q96C19 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFHD2Q96C19 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms