Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SPSB1Q96BD6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPSB1Q96BD6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms