Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTSSAQ969W0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms