Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CAVIN3Q969G5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms