Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BHMTQ93088 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHMTQ93088 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms