Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FRAT1Q92837 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms