Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms