Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSMEM1Q8WWF3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms