Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGDCC4Q8TDY8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGDCC4Q8TDY8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms