Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRSK1Q8TDC3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms