Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTLL11Q8NHH1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTLL11Q8NHH1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms