Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COL22A1Q8NFW1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL22A1Q8NFW1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms